Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CBX3Q13185 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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CBX3Q13185 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
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CBX3Q13185 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CBX3Q13185 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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CBX3Q13185 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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CBX3Q13185 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CBX3Q13185 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CBX3Q13185 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
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