Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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PTPRJQ12913 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTPRJQ12913 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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