Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLFN5Q08AF3 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SLFN5Q08AF3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms