Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
RPIAP49247 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPIAP49247 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms