Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GTF2E1P29083 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GTF2E1P29083 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms