Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PRICKLE3O43900 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PRICKLE3O43900 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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