Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RAD54BQ9Y620 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms