Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HDGFL3Q9Y3E1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms