Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP35Q9P2H5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP35Q9P2H5 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
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