Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008991.1-201ENST00000591285 537 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00907-207ENST00000591381 1291 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010271.2-201ENST00000614440 588 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157392.3-206ENST00000614899 822 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNHIT3-209ENST00000620324 834 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN16-201ENST00000340487 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFPL2-201ENST00000248980 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFPL2-202ENST00000248983 1474 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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KRTAP9-4Q9BYQ2 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf186-201ENST00000331555 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PIH1D3-202ENST00000372453 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL022100.1-201ENST00000636624 1678 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TAGAP-202ENST00000338313 1183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 Y_RNA.476-201ENST00000384347 108 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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KRTAP9-4Q9BYQ2 NPIPB2-202ENST00000399147 1194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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KRTAP9-4Q9BYQ2 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFX-AS1-201ENST00000427551 417 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 CELF2-AS2-202ENST00000432370 1227 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01598-202ENST00000445151 719 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL645474.1-201ENST00000451797 493 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL358612.1-201ENST00000452911 481 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 DEFT1P2-201ENST00000453669 421 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01140-203ENST00000469312 1298 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
KRTAP9-4Q9BYQ2 MGC32805-201ENST00000503529 579 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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