Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SGIP1Q9BQI5 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms