Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
C9orf40Q8IXQ3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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