Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms