Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV0

NBPF1, Neuroblastoma breakpoint family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF1Q3BBV0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NBPF1Q3BBV0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBPF1Q3BBV0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms