Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CDC42EP1Q00587 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms