Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
EPCAMP16422 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms