Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SHOC2Q9UQ13 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
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