Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC132872.1-201ENST00000566986 1195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RABGEF1Q9UJ41 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 AC022726.2-201ENST00000634673 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RABGEF1Q9UJ41 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms