Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG3Q9NT62 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG3Q9NT62 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms