Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW2

SHD, SH2 domain-containing adapter protein D, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHDQ96IW2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SHDQ96IW2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SHDQ96IW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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