Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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C9orf40Q8IXQ3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf40Q8IXQ3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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