Protein–RNA interactions for Protein: Q702N8

XIRP1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP1Q702N8 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XIRP1Q702N8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP1Q702N8 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.9 ms