Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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RTL6Q6ICC9 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RTL6Q6ICC9 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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