Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GTF2H3Q13889 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms