Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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ITGB3BPQ13352 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ITGB3BPQ13352 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ITGB3BPQ13352 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
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