Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
KRTAP1-1Q07627 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms