Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Crisp3Q03402 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms