Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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FAM3AP98173 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FAM3AP98173 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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