Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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PTPRAP18433 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPRAP18433 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
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