Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
COX6A1P12074 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms