Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
KDM6BO15054 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
KDM6BO15054 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms