Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
STRCP1A6NGW2 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms