Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y448

KNSTRN, Small kinetochore-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRNQ9Y448 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KNSTRNQ9Y448 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms