Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
DEPPQ9NTK1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms