Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zbed3Q9D0L1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Zbed3Q9D0L1 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Zbed3Q9D0L1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms