Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
TRAF4Q9BUZ4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TRAF4Q9BUZ4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms