Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
NDUFAF3Q9BU61 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms