Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RTKNQ9BST9 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RTKNQ9BST9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms