Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ69

C11orf40, Putative uncharacterized protein C11orf40, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf40Q8WZ69 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
C11orf40Q8WZ69 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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C11orf40Q8WZ69 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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C11orf40Q8WZ69 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
C11orf40Q8WZ69 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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