Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PERM1Q5SV97 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PERM1Q5SV97 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms