Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SCN9AQ15858 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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