Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
EBI3Q14213 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
EBI3Q14213 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms