Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GRIK3Q13003 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GRIK3Q13003 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
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