Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
FOXO1Q12778 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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FOXO1Q12778 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
FOXO1Q12778 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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