Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HSF1Q00613 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms