Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
PKD1P98161 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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