Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CYB561P49447 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms