Protein–RNA interactions for Protein: O43543

XRCC2, DNA repair protein XRCC2, humanhuman

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC2O43543 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
XRCC2O43543 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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