Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSDA5PKW4 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PSDA5PKW4 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSDA5PKW4 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms