Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CHRNA9Q9UGM1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms